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科学家揭开赤霞珠基因组
2016-11-29 15:26:13   来源:中外葡萄与葡萄酒   作者:李旋编译   评论:0

赤霞珠是世界上最受欢迎的酿酒葡萄品种,科学家们利用复杂的软件对其进行了基因测序。由于葡萄酒产区受到气候变化的影响,该研究结果有利于找到培育顶级葡萄品种的方法。

参与赤霞珠基因组计划的著名科学家、加州大学戴维斯分校葡萄遗传学专家Dario Cant副教授说:“研究中所指的技术进步,是指揭示了赤霞珠和其他酿酒葡萄品种之间的不同,这项研究可以帮助葡萄育种者把优良的特性融入到新品种中。”

该软件称为FALCON-unzip,是太平洋生物科学公司(Pacific Biosciences)结合新的DNA测序技术开发的。研究人员用这种方法获得了三种生物体的基因组,其中包括赤霞珠。软件的详细介绍及测序结果发表在10月份的《Nature Methods》杂志上。

虽然早在2007年,意大利和法国研究人员首次公布了葡萄的基因组测序,但当时使用的是专门为测序培育的品种,不是酿酒葡萄品种。而该研究使用的是商业上可用的赤霞珠品种。

Cantu解释说:“目前最受欢迎的品种是杂交品种,对它们进行详细分析很复杂,也很困难。我们现在知道,赤霞珠是品丽珠和长相思的杂交后代,这可以帮助我们解释它固有的复杂性,以及为什么很难确赤霞珠品种特定的遗传特征。”

Cantu认为,该技术最大的应用潜力将是帮助克服气候变化对葡萄种植的影响。他说:“我们已经建立的葡萄栽培区可能很快会变得不太理想,如果我们希望继续种出好葡萄来酿造高品质葡萄酒,这些品种应该可以更适应高温、干旱,甚至盐度。”

编制各种葡萄品种的基因组的目录也有助于准确描述遗传标记与酿酒师想要的特定的风味、葡萄酒中健康的化合物、抵抗葡萄园病虫害以及其他期望的性状之间的关系。这些数据可以帮助人们通过育种或者遗传修饰的方法进行不同品种之间的基因组合。你想得到一种既具有萨格兰蒂诺(Sagrantino)风味特点又具有白布娃(Blanc du Bois)品种耐湿性的葡萄吗?科学家可以识别出特定的遗传标记,并进行相应的培育。

测序技术还可以帮助科学家更好的了解葡萄品种的历史。最近的一项研究发现,黑皮诺经常出现的突变可能是由于它们可以吸收攻击病毒的遗传物质。这些信息可以帮助我们在基因水平上了解葡萄发生了什么变化。

通过研究给定品种的基因组,科学家可以发现他们的父母遗传给它们的各种性状。例如在赤霞珠中,哪些遗传物质来自于品丽珠,哪些遗传物质来自于长相思呢?更重要的是,他们是如何一起工作的?

Cantu认为,这仅仅是一个开始。在未来几年,我们将获得更多知识,例如最优质的酿酒葡萄品种是如何工作的?怎样让它们变的更好?

编辑:张瑜宸

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